开年第一周,北京、河北、辽宁多地新冠确诊病例增多,疫情似乎有“卷土重来”的意思。但值得庆幸的是,针对疫情的检测环节,我们迎来了一个好消息。
湖北大学省部共建生物催化与酶工程实验室马立新团队自主开发了一套全新的新冠检测技术,通过将可编程核酸酶PfAGO与RT-PCR技术相结合,实现对新冠病毒核酸的高灵敏、高准确度快速检测,同时该方法可以区分新冠病毒的突变体。实验检测结果表明,通过该方法新冠核酸检测特异性和准确度达到了%。
目前,马立新团队所著的研究论文《基于PfAgo的新冠病毒核酸检测》已发表于BiosensorsandBioelectronics。
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《基于PfAgo的新冠病毒核酸检测》
回忆起研究的初衷,马立新表示,“最初是想做新的基因编辑酶,因为Crispr编辑技术都是外国人发明的,专利都是外国人的,所以我们就想从Argonaute入手,希望能研究出有自主知识产权的基因编辑方法。在这个过程中,意外发现了PfAgo的独特性质。”
年年初疫情肆虐,马立新想到了PfAgo可以用作新冠的核酸检测,但因为武汉封城,导致大部分师生都没办法返校,留校的师生也没办法进实验室工作。这让整个团队都很着急。
“我们对自己的实验设计还是很有信心的,希望能尽快将自己的方法建立起来,为新冠疫情做点什么。”马立新的学生王飞回忆道。“4月份武汉开始复工后,我们回到停摆了3个月的实验室发现,很多材料都坏了,连纯水系统都不能正常工作,我们克服了很多困难才完成了这个方法。”
虽然过程很艰辛,但结果是美好的。通过团队的研磨,自主开发了国内首个基于PfAGO的核酸检测法。
马立新告诉DeepTech,PfAgo可以用切割双链PCR产物产生的单链DNA作为向导发动下一轮的切割,这是PfAgo核酸检测法成立的基础。
PfAgo,一个隐藏在可编程内切酶里的“福尔摩斯”
年12月中旬开始,北京接连几天爆出感染病例,让大家再度紧张起来。根据北京疾控中心公开披露了病源流调显示,一位印度尼西亚籍男子年11月26日入境,为1例境外输入病例同航班密切接触者;在福建隔离满14天,经核酸检测为阴性后,于12月10日到达北京;12月26日该男子检测新冠病毒核酸阴性,血清IgM抗体阳性;12月27日在其居住地及工作地点环境中,检出新冠病毒核酸阳性;12月28日检测新冠病毒核酸为阳性,综合流行病学史、临床表现、实验室检测和影像学检查等结果,当日诊断为无症状感染者。
不难看出,该男子前后至少经历了4次以上的核酸检测,但直到最后确诊才明确检测出新冠病毒核酸为阳性。除了受到体内抗体等因素的影响,新冠检测的精准度问题再次引发公众